需求 客户的一个简单需求: 我有一批功能基因位点,想从重测序的群体材料中找到这些位点,如何批量快速获得? 示例文件 gene.txt test....

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vcf格式是做变异(variant)分析的时候最常见的一种格式,主要包括一些header和位点的信息。可以参考这个说明文档学习:https://...
前言 很多关注我这个专题的朋友都在后台留言,说想了解更多关于SNP过滤的东西。是的,确实这是一个比较重要的问题。第一,过滤到一些低质量的SNP可...
vcftools是用来处理vcf和bcf文件的工具集,功能涵盖了过滤,数据格式转换,一些指标的统计计算,vcf文件之间变异信息的差异比较等等。 ...
在用于存储reads比对结果的SAM/BAM格式提出之后(2009年),用于存储变异检测结果的格式VCF( variant call forma...
写在前面:当学习某一重要文件格式时,更需要对此格式对应软件工具进行全面的学习(如sam/bam——samtools)。在多次花时间写脚本处理文件...
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