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    GFAP---pfam_go_kegg模块

    后来发现,即便努力实现了各科代表物种的注释,但在某些情况下还是直接注释可能更方便些。于是对GFAP添加了一个新的模块,该模块直接用pfam, G...

  • GFAP---关于版本的汉化

    早年用一些外国软件的时候总是希望能够找到汉化版本,到自己做软件了,反而忽视了这个问题。既然本照着为同学们解决问题的原则,今天终于将GFAP进行了...

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    GFAP---Gene family模块

    嗯,与上一章(GFAP---Transcription factor)的基本操作相同,不浪费同学们宝贵的时间了。区别点在于,该模块所针对是非转录...

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    GFAP---Transcription factor模块

    对于一些没有生信基础的同学来说,想要从一堆未知功能的基因中挑选出想要的转录因子,可能还要花费大量的时间成本去学习这个过程。而转录因子又在植物中起...

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    GFAP---KEGG analysis模块

    该模块主要用于KEGG分析以及作图。首先,需要得到相应基因的KEGG以及KO IDs: 输入文件是先前的比对文件,选择近缘物种,然后保存并命名,...

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    GFAP---GO analysis模块

    GO富集分析是基因功能分析中非常重要的一个大类,其主要的作用是为了人们提供基因发挥作用的类型指导,即感兴趣的基因到底在哪些生物学进程中发挥作用。...

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    GFAP---superHMM模块

    GAFP的所有注释信息是基于蛋白结构域而来。superHMM模块它的主要作用是检测输入序列其完整蛋白序列中所含有的功能域的。界面分布如下: 如上...

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    GFAP---Alignment模块

    Alignment,即比对。这是在进行所有功能注释几乎都要进行的一步。如下图所示: 如图所示,该模块可分为三个大的区域。事实上,做出软件功能只是...

  • 为什么要做这样一款用于植物基因功能注释的软件?

    在开篇,我觉得应该首先和同学们说一下如题所示的问题。我发现到目前为止,可用于基因功能注释的网站还是有很多的,但绝大多数网站所收录的植物物种实在太...

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