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基于Python的Scrublet工具去除双细胞-批量运行
参考生信技能树教程https://mp.weixin.qq.com/s/i6_x1yeMbXawfKm36ewnKQ[https://mp.we...
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单细胞注释-marker参考
A Guide to T Cell Markers[https://www.biocompare.com/Editorial-Articles/...
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单细胞测序上游分析-从原始数据到cellranger定量单细胞系列教程目录索引,持续更新...[https://www.jianshu.com/p/98fc6c80c216] 为避免造成环境污染，建议...
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细胞交互CellphoneDB v3
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清空不同Resolution分群走向的历史信息
单细胞系列教程目录索引,持续更新...[https://www.jianshu.com/p/98fc6c80c216] 在对大类注释好的数据集进...
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pySCENIC转录因子分析
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肿瘤样本中的正常上皮鉴定-参考Nature Communications单细胞系列教程目录索引,持续更新...[https://www.jianshu.com/p/98fc6c80c216] 参考文献：Single-...
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新-03.使用SCTransform标准化流程质控降维
具体改进： 使用了Seurat官网更新的最新标准化方法SCTransform v2，此方法在下游注释中可更佳清晰的分辨细胞亚群。 添加了Harm...
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03.查看不同粒度下的分群走向在对粒度进行选择或注释存在疑问时，往往需要对粒度进行调整，为方便的查看不同粒度下的细胞走向，使用以下代码进行可视化。 参考来源：https://...
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