之前写过画桑基图和网络图的推文：https://www.jianshu.com/p/ff295d3444b4。今天发现，桑基图居然没办法直接保存为pdf，png这些常用的格式。搜索了一下，发现需要借助外力–webshot包。
1.画桑基图
library(tidyverse)
library(navdata)
library(networkD3)
data("phone.call2")
nodes <- phone.call2$nodes;head(nodes)
## # A tibble: 6 x 2
## id label
## <int> <chr>
## 1 1 France
## 2 2 Belgium
## 3 3 Germany
## 4 4 Danemark
## 5 5 Croatia
## 6 6 Slovenia
edges <- phone.call2$edges;head(edges)
## # A tibble: 6 x 3
## from to weight
## <int> <int> <dbl>
## 1 1 3 9
## 2 2 1 4
## 3 1 8 3
## 4 1 9 4
## 5 1 10 2
## 6 1 11 3
nodes_d3 <- mutate(nodes, id = id - 1);head(nodes_d3)
## # A tibble: 6 x 2
## id label
## <dbl> <chr>
## 1 0 France
## 2 1 Belgium
## 3 2 Germany
## 4 3 Danemark
## 5 4 Croatia
## 6 5 Slovenia
edges_d3 <- mutate(edges, from = from - 1, to = to - 1);head(edges_d3)
## # A tibble: 6 x 3
## from to weight
## <dbl> <dbl> <dbl>
## 1 0 2 9
## 2 1 0 4
## 3 0 7 3
## 4 0 8 4
## 5 0 9 2
## 6 0 10 3
p = sankeyNetwork(
Links = edges_d3, Nodes = nodes_d3,
Source = "from", Target = "to",
NodeID = "label", Value = "weight",
fontSize = 16, unit = "Letter(s)")
p
image
2.保存
主要是因为这个桑基图是互动式的。只能导出为html，没有其它选项。如果是forceNetwork出的图，可以在这里手动点保存输出，可桑基图不行。
network3D自带一个saveNetwork函数，只能导出html。
saveNetwork(p,"sankey.html")
这个函数刚好可以对接webshot，把html保存为pdf或者png，干就完事！
这个包需要依赖phantomjs,我搜到的结果是需要自己装，结果发现作者把安装的动作也写成R语言函数了，非常舒适。
library(webshot)
if(!is_phantomjs_installed()){
install_phantomjs()
}
is_phantomjs_installed()
## [1] TRUE
只要上面是TRUE了，保存就没有问题。
webshot("sankey.html" , "sankey.png")
webshot("sankey.html" , "sankey.pdf")
