2023-03-15 重测序pipeline遇到的问题

  1. 做samtools mpileup过程中出现乱码。

这个是samtools版本的问题,这版samtools不支持-o关键字,改成管道输出。

  1. bcftools filter有问题。

也是版本的问题。使用新版本,路径:/home/heyx/program/bcftools-1.15.1/bcftools

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  • http://samtools.github.io/bcftools/bcftools.html https://...
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