纤蹄马 - 简书

纤蹄马

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ClusterGVis: Heatmap+Mfuzz+GO/KEGG
ClusterGVis是一个基因表达数据可视化的R包，由中国药科大学Jun Zhang博士开发，可以同时绘制聚类+分组表达趋势折线图+功能注释的...

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基因组重测序分析干货
### 一般从测序公司拿到的下级数据有raw data，或者经过质控之后的clean data，格式为fq。参考基因组及注释文件gff从网上下载...

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如何上传转录组数据到NCBI的SRA数据库
建议大家把数据上传到我们自己的数据库（http://bigd.big.ac.cn/），支持国产。由于我的数据太差了，还是传到NCBI吧~ 第一步...

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国内第一篇植物单细胞测序
之前关注王佳伟在植物发育阶段转变过程中调控机制的研究，洲更在生信界也是大名顶顶，不知道他们是一个课题组的。用到的统计方法有：t-SNE和UMAP...

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SOAPdenowo
SOAPdenovo是一个新颖的适用于组装短reads的方法，能组装出类似人类基因组大小的de novo草图。该软件特地设计用来组装Illumi...

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一个纠结的晚上
前天文章终于online了，本来是个好消息，却高兴不起来。因为不是按照最新版本，有几个错误没改过来。 9.5我把修改好的最终版本邮件发给编辑，为...

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GO 和 KEGG 注释之前，为什么要先进行序列比对（BLAST）？
在进行功能注释和通路注释之前，我们会先将差异蛋白与合适的数据库中的蛋白序列进行比对。目的一：很多物种目前研究的程度还很有限，关于这些物种的蛋白注...

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filled.contour绘制栅格图
今天帮一个同学做了几个图，用到filled.contour这个函数，在一个有点傻的地方耗费了我大量精力。最后保存作图的时候如果保存成pdf 格式...

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陪小宝读书之百年孤独
这本书的复杂性就跟百年孤独这个名字一样，要把一百年的孤独写尽，该是一部怎样壮烈的文辞。这是一部无关爱情的浪漫的书，每个人都在用自己的方式孤独着...

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