1905年科举废除,因此进士馆共招收癸卯科与甲辰恩科两批进士学员。1906年,学部奏准将进士馆甲辰科内班(即新班)派赴日本东京政法大学补修科学习,外班学员与未入馆学习的癸卯甲辰科进士派到速成科学习。
另外因故未到馆学习的内班学员,由学部通咨各省催促来京与外班各员入速成科学习。9月21日,学部公布83名赴日游学名单,并向驻日大臣杨枢发文“请照单分别送学”,其中38名送入法政大学补修科,45名送入速成科。
同年,赴东游学的还有沈家彝、唐宗愈、吉祥、蒋棻、梁载熊等五名仕学馆员,另有仕学馆员李文权由学部批准赴各国游历。
1907年初,进士馆旧班业。学部认为各学员可以派赴东西各国游历以资考镜,毕业学员亦“先后禀请学部出洋游历”。6月10日,学部咨送旧班朱寿朋等67名学员赴东游历。出洋游学进士回国后经过考验得到程度不同的奖励。
1906年官员游历还包括16省提学使的出洋考察。是年各省学政改称提学使,学部要求各提学使除前经出洋及办理学务资劳久著者外,均须赴日考察学务三个月,归国后再赴任。
1906年新任命的各省提学使共23名,其中无海外游历体验的有16人,分别为:湖北黄绍箕(考察团长)、浙江支恒荣、山西锡嘏、湖南吴庆坻、黑龙江张建勋、甘肃陈曾佑、吉林吴鲁、福建姚文倬、辽宁陈伯陶、江西汪诒书、新疆杜彤、云南叶尔恺、广西李翰芬、陕西刘廷琛、山东连甲、安徽沈曾植。提学使一行自8月4日从上海出发赴日游历。
同时,学部还派右参议林灏深等六人参加提学使考察团共赴日考察学务。