计算群体分化指数

官方操作指南

https://vcftools.github.io/documentation.html


用苹果终端做

cd ../../Users/apple/Documents/test

./vcftools --vcf test.filter.prune.in.vcf --weir-fst-pop pop_1.txt --weir-fst-pop pop_2.txt --out pop1_vs_pop2

pop1文本格式如下,亚群里每个样本放在一个txt里


结果


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