2021-07-11 U1 snRNA的非剪接功能-2

        之前我们介绍了一种U1 snRNA的非剪接功能——通过与lncRNA互作调控这些lncRNA在染色质上的定位,进而影响基因转录。今天分享的是同一个课题组分别在2010年发表在Nature上和2012年发表在Cell上的关于U1 snRNA的非剪接功能——抑制pre-mRNA的过早切割与加多聚腺苷尾(premature cleavage and polyadenylation,PCPA),从而起到调节mRNA长度的目的。

U1 snRNP介导的PCPA

三言两语

1.在2010年发表在Nature的文章中,研究者使用AMO(antisense morpholino oligonucleotide,反义吗啉环寡核苷酸,一种可以靶向RNA,但不诱导RNA切割的反义核酸,可以实现对RNA的封闭,阻止靶标RNA与其他分子的结合)靶向U1,发现除了抑制RNA剪接外,还会导致一些RNA出现PCPA。进一步分析发现,在基因的intron中也常常存在多聚腺苷化加尾信号(AAUAAA),而U1 snRNA则可以通过与intron 中AAUAAA序列互作阻止其作为多聚腺苷化的信号及其介导的RNA切割与多聚腺苷化加尾。

2.在2012年发表在Cell上的研究中,研究者开发用于检测不同转录本的HIDE-seq技术,并且在中等强度抑制U1 snRNA的情况下,通过HIDE-seq检测mRNA的转录本发现,mRNA会因为PCPA的抑制解除而产生不同长度的变体。

Reference

1.Kaida, D. et al. U1 snRNP protects pre-mRNAs from premature cleavage and polyadenylation. Nature 468, 664-668 (2010).

2.Berg, M. G. et al. U1 snRNP determines mRNA length and regulates isoform expression. Cell 150, 53-64 (2012).

3.Merkhofer, E. C. & Johnson, T. L. U1 snRNA rewrites the "script". Cell 150, 9-11 (2012).

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