生信学习小组Day5笔记——面壁润

R语言的基础

不知不觉中,学习已经到了第五天了,今天要学习的内容是R语言基础之数据结构。万丈高楼平地起,继续跟紧花花姐的脚步,继续打好R语言基础。

一、学习的思维导图

零基础生信Day5.png

二、一些十分重要的知识点

1. R的赋值符号:<-
2. 在consloe控制台输入命令
3. R的代码中的括号必须是英文字符,否则会error
4. 查看工作路径:getwd( )
5. 向量是由元素构成,元素可以是数字和字符串
6. 表格在R中,被称为data.frame,数据框
7. 遇到不懂的代码,可查看帮助,如?read.table
8. 数据类型:向量,矩阵,数组,数据框,列表

三、R Studio的实操过程

1、何为向量

  • 多个元素组成的变量,一个向量是一排有序的元素。
  • 而元素是由数字或者字符串(chr)构成。
  • 字符串在R中使用,必须加引号。

2、何为赋值

x<- c(1,2,3) #常用的向量写法,意为将x定义为由元素1,2,3组成的向量。
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
class(x)
[1] "integer"
x<- seq(1,10,by = 0.5)  #1-10之间每隔0.5取一个数。
x
[1]  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0
[14]  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
1.png

2.png

3.png

3、向量中元素提取

x[4] #x第4个元素
x[-4] #排除法,除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4] #第2到4个元素
x[-(2:4)] #除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
x[x==10] #等于10的元素
x[x<0] #小于0的元素
x[x %in% c(1,2,5)] #存在于向量c(1,2,5)中的元素
4.png

4、数据框

#读取
a <- read.table(file = "huahua.txt", sep='\t', header = T)
class(a)
[1] "data.frame"
# 查看列名
colnames(a)
[1] "X1" "X2"
#查看行名
rownames(a) 
[1] "1" "2" "3" "4" "5"
#修改左上角第一个格子名称
colnames(a)[1]<-"bioplanet"
#最后row.names的意思是修改第一列为行名
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)
#数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)
# 保存当前所有变量
save.image(file="bioinfoplanet.RData") 
#保存其中一个变量;
save(X,file="test.RData") 
#变量载入
load("test.RData")
5.png

X.png

6.png
# 数据框元素提取
a[5,1]#第5行第1列
a[5,]#第5行
a[,2]#第2列
a[2] #也是第2列
a[1:2]#第1列到第2列
a[c(1,2)]#第1列和第2列
a$X2#也可以提取列
7.png

四、作业

save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found,是为什么,应该怎么解决?
答:这个报错提示,对象X不存在,我们需要检查大小写,是否我们把小写 “x” 看做大写 “X”, 在R语言中,字母的大小写是有严格区分的。

结语

加油!我可以的!期待明天的新课!

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