02. PPCM两篇(一)

题目:Peripartum Cardiomyopathy as a Part of Familial Dilated Cardiomyopathy

作者:K. Y. van Spaendonck-Zwarts等

期刊:Circulation

发表时间:2010年5月

网址:https://www.ahajournals.org/doi/full/10.1161/CIRCULATIONAHA.109.929646?url_ver=Z39.88-2003&rfr_id=ori:rid:crossref.org&rfr_dat=cr_pub%20%200pubmed

简介:本文发现的是PPCM和DCM患者中可同时存在于一个家族,且在1个家族中发现了DCM致病基因中有1个致病性突变。

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一. 研究人群

       Department of Cardiology, University Medical Centre Groningen所收集的DCM病例及PPCM病例。

DCM定义为:reduced systolic function of the left ventricle (LVEF <0.45) and dilation of the LV (LV end-diastolic dimension >117% of the predicted value corrected for BSA and age) and only after identifiable causes like severe hypertension, coronary artery disease, and systemic diseases have been excluded.

FDCM定义为:there are ≥2 affected family or if a first-degree relative of aDCM patient died suddenly before 35 years of age.

PPCM定义为:development of cardiac failure in the last month of pregnancy orwithin 5 months after delivery; LV systolic dysfunction (LVEF <45%); noidentifiable cause for cardiac failure, and no recognized heart disease beforethe last month of pregnancy. 但本文中该兴趣的为1年内未完全康复(左心室功能和尺寸恢复正常)的病例。

对照人群

300 ethnically matched control

二. 方法

1. 基因分析

       分析的基因

        LMNA、TNNT2、MYH7的外显子及相邻的参与剪接的内含子区域。但在某个家族(家族1b)中,涉及到了ACTC1、CSPR3、DES、LMNA、MYBPC3、MYH7、TNNC1 、TNNI3、TNNT2、TPM2。

       突变检测方法

       变性高效液相色谱分析、变性梯度凝胶电泳、测序。为检测LMNA基因较大的缺失或重复 (>1个外显子),使用multiplex ligation-dependentprobe amplification test。

三. 结果

1. 含PPCM的FDC检索

       由于本文中对含PPCM的FDC检索分为两个步骤(见讨论)

       1) 共90个FDC家族,其中5个家族中有≥1例PPCM。

       2) 3例PPCM患者(1年内未痊愈的患者)中,在其家族中均发现了未诊断的DCM。

2. 突变分析及解释

       5个DCM家族的先证者及3名PPCM患者未发现LMNA、TNNT2、MYH7的突变。

       但在家族1b中,发现了cardiac troponin C, TNNC中的一个突变(c.149A>G, p.Gln50Arg in TNNC1)。

       对于该突变,文中认为是致病的(pathogenic):

1) 该突变导致谷氨酸改变,而该氨基酸位于高度保守区域;

2) 该突变导致的谷氨酸改变位于参与到蛋白-蛋白相互作用的small critical linker region (3 amino acids) between 2 calcium-binding/EF-hand (helix-loop-helix),因此可能影响其正常功能;

3) 该突变在该家族中与疾病共分离;

4) 该突变未在对照组中出现;

5) 生物信息学软件预测的结果

PolyPhen-2

网站:http://genetics.bwh.harvard.edu/pph2/

输入:p.Gln50Argin TNNC1(P63316)

输出:HumDiv: Thismutation is predicted to be POSSIBLY DAMAGING with a score of 0.933(sensitivity: 0.80; specificity: 0.94)

HumVar: This mutation is predicted to be PROBABLY DAMAGING with a score of 0.943 (sensitivity: 0.65; specificity: 0.91)

SIFT

网站同下面的PROVEAN

输入:P63316 50 Q R

输出:SCORE:0.000    PREDICTION: Damaging

PROVEAN

网站:http://provean.jcvi.org/index.php

输入:P63316 50 Q R

输出:SCORE: -3.58    PREDICTION: Deleterious

四. 结论

       作者在90个DCM家族中发现了5例PPCM患者,以及在3例PPCM患者的家族中发现了DCM。在1个家族中国发现了一个新的致病性突变。因此作者认为PPCM的一部分是FDC的首发表现之一。

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佳句

PPCM probably develops as a result of a complex interaction of pregnancy-associated factors and genetic factors. In other words, against a background of genetic susceptibility, factors associated with pregnancy could lead to PPCM.

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讨论

1. 本文作者认为的本文的优缺点是什么?

       他们提出,该文第一个系统地研究PPCM和家族性DCM的关系。而此前一直认为PPCM是非家族性、非遗传所致的DCM。这项研究提示PPCM中可能有一部分为家族性的,PPCM可作为家族性DCM的首发临床表现的一种。这可能意味着针对于家族性DCM的遗传筛查和咨询可能扩展至PPCM患者,也可使有DCM家族史的孕妇警惕PPCM的发生。

       作者认为本文中PPCM患者数过少,使用PPCM进行筛查时使用了临床预后较差的病例,而未对所有PPCM进行筛查(文中给出的理由是考虑到可能有chances of identifying clinically relevant findings seemed smaller than the possible side effects [like psychological stress, unforeseen diagnostic findings outside this context, and problems with health insurance] that might arise from such screening)。基于此,也无法比较家族性DCM的PPCM患者与非家族性PPCM的患者的结局。

2. 你有什么想法?

       本文对于“Peripartum Cardiomyopathy as a Part of Familial Dilated Cardiomyopathy”的证明力度不足。文中发现的是PPCM和DCM患者中可同时存在于一个家族,且发现了1个家族中携带致病性基因。这种共存可能是巧合所致吗?可使用更大规模的样本,比较家族性DCM中PPCM的发生率与人群中PPCM的发生率(独立性检验?)来判断二者是否相关。

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题目:Rare Variant Mutations in Pregnancy-Associated or Peripartum Cardiomyopathy

作者:A. Morales等

期刊:Circulation

发表时间:2010年5月

网址:https://www.ahajournals.org/doi/full/10.1161/CIRCULATIONAHA.109.931220?url_ver=Z39.88-2003&rfr_id=ori:rid:crossref.org&rfr_dat=cr_pub%20%200pubmed

简介:作者在其FDC队列中的4110名女性中发现了45例PPCM/PACM,其中有测序数据的19例中有6例发现了可能的DCM致病基因。

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一. 研究人群

       Familial Dilated Cardiomyopathy Research Project cohort 4110名女性。 

DCM定义为:left ventricular enlargement with systolic dysfunction, with coronary artery disease, cardio-toxic exposures, and other known causes ruled out

FDC定义为:DCM in which the patient and at least 1 relative had IDC

PPCM及PACM定义:onset during pregnancy or 5 months after pregnancy and for cardiovascular dataindicating an EF <50% and/or M-mode fraction <30% and LV end-diastolic dimension >97.5th percentile based on a gender- and height-based method

二. 方法

分析的基因

       14名患者共测序了14个基因:CSRP3, LDB3, MYH7, SCN5A, TCAP, TNNT2, LMNA, PSEN1, PSEN2, MYBPC3, MYH6, TNNIC, TNNI3, TPM

       1名测序除LMNA, PSEN1, PSEN2之外

       1名测序除PSEN1, PSEN2之外

       1名仅测序LMNA

       1名测序LMNA, PSEN1, PSEN2, MYBPC3, MYH6, TNNIC, TNNI3, TPM(其父测序了剩余的CSRP3, LDB3, MYH7, SCN5A, TCAP, TNNT2)

       1名测序SCN5A

测序方法

       Capillary-based Sanger sequencing,包括外显子及附近的内含子区域。

三. 结果

       1) Familial Dilated Cardiomyopathy Research Project cohort中的4110名女性中发现了45例PPCM/PACM,其中42例unrelated cases。其中23例为FDC,12例为散发,其余7例分类不明。19例符合PPCM(其中有一对姐妹),8例PACM,其余18例分类不明。

       2) 19名患者(13例FDC,6例散发性)有genetic data。6例中发现了nonsynonymous mutation。5例为PPCM,其中3例FDC,2例散发性。1例为PACM,为家族性。

Pedigree A: 白人。PACM,家族性。MYBPC3 Arg272Cys

Pedigree B:黑人。PPCM,家族性。MYH7 Gly1808Ala.

Pedigree C:白人。PPCM,家族性。SCN5A Arg222Gln

Pedigree D:白人。PPCM,PPCM, 家族性。PSEN2 Ser120Leu

Pedigree E:西班牙裔。PPCM,散发性。MYH6Arg568Cys

Pedigree F:白人。PPCM,散发性,TNNT2 Arg159Gln

四. 结论

       作者在其FDC队列中的4110名女性中发现了45例PPCM/PACM,其中有测序数据的19例中有6例发现了可能的DCM致病基因。因此有一部分PPCM/PACM可能是由遗传因素造成。

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讨论

1. 该篇与上一篇有什么异同?

       两篇文章发表于同一期Circulation杂志上,均研究了PPCM是否可能由遗传因素所致。两者的思路相似,收集PPCM病例,寻找其相关基因上的突变。检测的基因数量少、发现的突变少,在解释突变时,均采用了发现突变后人工审阅(利用对照组内突变频率、功能学数据、生物信息学分析预测、家系分析以及之前的文献报道等数据)。

       后者除了典型的PPCM外,还纳入了PACM(在其之前的研究中,PACM与PPCM的临床结局没有显著差异,他们认为可以认为是同一疾病的不同)。前者在收集病例时分为两步。第一步是检索DCM病例的家族中是否有PPCM病例。第二步是检索PPCM病例的家族中是否有DCM患者。后者本身所搜索的队列人数更大。

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