作为三剑客之一的awk的功能不用多介绍了，文本处理能力不输Perl，尤其是在命令行快速使用。（当然Perl的单行命令也是很强的）
需求
我有一个表格1（转录因子数据库文件）table1.xls：
image.png
还有一个表格2（典型的
blast m8格式输出结果，第一列是geneID，第二列是转录因子数据库ID）table2.xls：
image.png
我想要得到这样一个表格table3.xls：
image.png
题外话：有朋友要问了，为什么比对结果文件的subject有两个Ensembl ID呢？这是因为转录因子数据库的ID本来就有两个呀，所以比对到也就两个咯。咳咳，好像没答到点子上，因为我也不知道，大概是Isoform咯。
image.png
处理
awk -F' ' '{print $2" "$(NF-1)" "$NF}' table1.xls | \\
awk -F' ' 'NR==FNR{a[$1]=$0;next}{split($2,array,/:/);if (array[1] in a) print $1" "a[array[1]];else if(array[2] in a)print $1" "a[array[2]]}' - table2.xls >table3.xls
