PCA降维算法

降维是机器学习中很重要的一种思想。在机器学习中经常会碰到一些高维的数据集,它们会占用计算机的内存和硬盘空间,而且在运算时会减缓速度。
降维能够使得数据量被压缩,加快运算速度,减小储存空间,以及方便可视化的观察数据特点。

PS:在降维中,我们减少的是特征种类而不是样本数量,样本数量m不变,特征值数量n会减少。

主成分分析算法(PCA)

一种常用的降维算法是主成分分析算法(Principal Component Analysis),简称PCA

PCA是通过找到一个低维的线或面,然后将数据投影到线或面上去,然后通过减少投影误差(即每个特征到投影的距离的平均值)来实现降维。

上图是一个包含二维特征值的样本集。黑色的叉代表样本,红色的线表示找到的低维的线,绿色的叉则是样本投影在线上的位置。而它们的投影距离就是PCA算法所需要考虑的。

通过上图可以看出PCA算法就是找出一个线,在数学上就是一个向量,使得其他样本投影到该向量上的距离最小。

推而广之:
一般情况下,将特征值的维度从n降到k,就是找到k个向量u^{(1)},u^{(2)},...,u^{(k)},使得样本在这些向量上的投影最小。

例如,2维降到1维,就是找到1个向量,即一条线;3维降到2维,就是找到2向量,即一个平面。

PCA和线性回归的区别

  • 在线性回归中,最小化的是没有样本到预测线的平方误差,它们之间的距离是垂直距离。
  • 在PCA中,最小化的是投影距离,或者说是正交距离。

算法过程

数据处理

假设有m个样本集:x^{(1)},x^{(2)},...,x^{(m)}
下面需要对数据做一下特征值缩放或者均值归一化。
先计算出平均值,然后用样本值减去平均值。
\mu_i=\frac{1}{m}\sum_{i=1}^m x_j^{(i)}
然后用\frac{x_j^{(i)}-\mu_i}{s_j} 替换x_j^{(i)}s_j可以是数据最大值最小值的范围或者标准差。

算法部分

  1. 计算协方差矩阵(covariance matrix)
    \Sigma = \frac{1}{m}\sum^m_{i=1}(x^{(i)})(x^{(i)})^T
    PS:假设x^{(i)}为一个n维向量(n * 1),(x^{(i)})(x^{(i)})^T则是一个n维方阵。

  2. 计算协方差矩阵的特征向量(eigenvectors)
    可以通过奇异值分解(SVD)来获得:

[U,S,V] = svd(Sigma);

我们需要的就是矩阵U,他是一个n维方阵U \in \mathbb{R}^{n \times n},它的每一列就是我们需要的向量:
U = \left[ \begin{matrix} u^{(1)} & u^{(2)} & ... & u^{(n)} \\ \end{matrix} \right]

  1. 获取Ureduce矩阵
    当要从n降维到k,从矩阵U中取前k个向量就可以了:
    Ureduce = \left[ \begin{matrix} u^{(1)} & u^{(2)} & ... & u^{(k)} \\ \end{matrix} \right]

  2. 计算投影后的矩阵
    z^{(i)} = Ureduce^T \cdot x^{(i)}
    PS:Ureduce^T 是一个 k×n 维的矩阵,x^{(i)} 是一个n×1维的向量,两者点乘后就是一个z×1的向量,这样就得到了我们需要的。

回到原来的维度

使用Ureduce矩阵可以降维:
z^{(i)} = Ureduce^T \cdot x^{(i)}
那么要回到原来的维度上去就需要:
x_{approx}^{(i)} = Ureduce \cdot z^{(i)}

这里我们只能得到原来的近似值

选择降维的维度

x_{approx}^{(i)}x^{(i)} 近似相等,两者之间的差就是投影误差,或平均平方映射误差:
\frac{1}{m}\sum_{i=1}^m || x^{(i)} - x_{approx}^{(i)} ||^2

数据的总变差(total variation),即样本的长度平方的均值:
\frac{1}{m}\sum_{i=1}^m || x^{(i)} ||^2

选择维度k的最小值的方法:
\frac{\frac{1}{m}\sum_{i=1}^m || x^{(i)} - x_{approx}^{(i)} ||^2}{\frac{1}{m}\sum_{i=1}^m || x^{(i)} ||^2} \leq 0.01

表示平方投影误差除以总变差的值小于0.01,用PCA的语言称之为保留了99%的差异性
PS:这个值是可以变化的,可以是95%,90%,85%等等。

使用循环验证的办法:
初始化k=1,然后计算出Ureduce,通过Ureduce计算出z^{(1)},z^{(2)},...,z^{(m)}x_{approx}^{(1)},x_{approx}^{(2)},...,x_{approx}^{(m)},然后通过上方的公式计算出值是不是小于0.01。
如果不是,增加k值,直到获得最小的k值满足条件。

快捷办法

[U,S,V] = svd(Sigma);

通过奇异值分解的到的矩阵S是一个n维的对角矩阵:
S = \left[ \begin{matrix} s_{11} & 0 & ... & 0 \\\ 0 & s_{22} & ... & 0 \\\ ... & ... & ... & ... \\\ 0 & 0 & ... & s_{nn} \end{matrix} \right]

通过这个矩阵可以来计算:
1 - \frac{\sum_{i=1}^k S_{ii}}{\sum_{i=1}^n S_{ii}} \leq 0.01
也可以用下面的式子:
\frac{\sum_{i=1}^k S_{ii}}{\sum_{i=1}^n S_{ii}} \geq 0.99
这种方法就非常快捷高效。

使用PCA的建议

我们在训练集上通过PCA获得矩阵Ureduce,在交叉验证集和测试集上就不能再使用PCA来计算矩阵了,而是直接用训练集里的矩阵来映射交叉验证集和测试集上的数据。

PCA最常用的就是压缩数据,加速算法的学习,或者可视化数据。

  • 压缩数据
    将数据压缩到合适的维度,用来加速算法。
  • 数据可视化
    将数据的维度降到2或3维以便画出图像。

PCA的错误用法,用来防止算法过拟合
算法过拟合的原因之一是算法过于复杂,特征值的维度过高,使用PCA可以降低维度,看起来会有效,但是实际上效果很差。防止算法过拟合还是使用正则化的方法来实现。

还有一个注意点。就是在设计一个机器学习算法时,不用一开始就考虑降维,先在不使用PCA的条件下设计算法,当算法出现问题,例如,算法计算过慢,占用大量内存...,之后当确定需要使用PCA的时候再继续使用。

转载自:
https://codeeper.com/2020/02/06/tech/machine_learning/dimensionality_reduction.html

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