Linux环境下的软件安装

今天的学习内容是Linux环境下的软件安装。首先需要了解conda，一个开源的软件包管理系统和环境管理系统，用于安装多个版本的软件包及其依赖关系，并在它们之间轻松切换。简言之，conda相当于Linux环境下的应用商店，用于软件的下载和安装。

minicoda的下载与安装

Miniconda是conda的精简版安装程序。它是Anaconda的小型引导程序版本，仅包含conda，python，它们依赖的软件包以及少量其他有用的软件包，包括pip，zlib和其他一些软件包。使用conda install command可以从Anaconda存储库中安装720+个其他conda软件包。

minicoda的下载

在官网找到相应的下载链接，复制该链接，使用wget命令下载

wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh

minicoda的安装

使用 bash Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh 命令进行安装，安装过程中根据提示输入enter或yes。

bash Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh

minicoda的激活

source ~/.bashrc

添加清华源镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

使用conda安装软件

conda list [-n env_name] # 查看当前环境(指定环境)下安装的包；
conda search pkg_name    # 查看安装包；
conda install pkg_name     #安装包
conda update pkg_name    # 更新指定的安装包；
conda remove pkg_name    # 卸载指定的安装包

使用conda创建环境

conda info --envs    # 查看当前现有的conda环境；
conda deactivate  # 退出当前的conda环境；
conda create -n env_name [python=<version>] # 创建环境，并指定python版本，或者安装包等；
conda remove -n env_name --all  # 删除指定环境

今天跟着课程指引顺利完成了minicoda的安装，并学会用conda安装软件等操作。同时也在conda官网查看有关conda的相关内容，进一步加深对conda使用的了解。