听了领读员的解读后收获
文章的亮点:揭示了佛手瓜的一次WGD事件
前言部分写作点:
测序物种的价值与意义:
1、生物学概述,XXX是什么,
2、经济价值高
3、为什么那么经济价值高,多人种植?活性成分
为什么要开展本物种测序:
4、同属其他种都测了基因组,但佛手瓜还没测
6、基因组测序是很重要的
本研究做了什么
7、8、9、我们做了什么(使用XX方法进行XX,得到XX)
10、强调意义(为后续育种、进化研究提供帮助)
结果:
二代数据评估基因质量:基因组大小、重复序列数量,杂合度、GC比例。三代组装了一个基因组,质量还可以。
K-mer的作用:提前了解一些基因组特性,决定是否继续测。K-mer分析可以得到:基因组大小、杂合度、重复片段大小。
Hi-C技术:全基因组范围内所有染色体的互作
重复序列分类:串联重复序列、散在重复序列(TE、LTR等)
讨论:
与结果部分一一对应。
首先,与其他近缘种的基因组进行对比。之后,WGD事件。然后转录组的差异表达基因。最后代谢组的发现。