写在前面
https://diseases.jensenlab.org/Search
DISEASES 每周更新,它集成了来自自动文本挖掘、手工整理的文献、癌症突变数据和全基因组关联研究的疾病基因关联证据。
可以根据基因(疾病)名称,查询到相关的疾病(基因)。并且有相应的文献链接。有的数据来自其他数据库,有的来自文本挖掘(需要看文献确认)。
针对不同来源的数据,会给出一个统一的score值,5颗星星代表可信度最高,1颗星星则可信度最低。
简单操作
- 在网站输入基因或疾病名称,比如
ApoE
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点击第一个ApoE进去,可以看到该基因相关疾病、数据来源、分值。
其中数据有三个来源,分别是Text mining (数据挖掘,需要进一步根据文献确认)、Knowledge(其他数据库)、Experiments(其他数据库)
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点击Text Mining中对应疾病名称,可以看到疾病介绍及相关文献。建议看下文章摘要确认是否真的有相关性,如果摘要中有相应的基因名会被自动标注出来。
点击Knowledge和Experiments相应的疾病,会跳转到对应数据库。
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同理,输入疾病名称,如
Alzheimer's disease
,则会出现与该疾病相关的基因名称。数据来源也是三种。