问题
你想从文件中载入数据。
方案
带分隔符的文本文件
最简单的输入数据的方式就是将其保存为带分隔符(如:制表位或逗号)的文本文件。
data <- read.csv("datafile.csv")
# 导入一个没有表头的CSV文件
data <- read.csv("datafile-noheader.csv", header=FALSE)
函数read.table()
是一个更为普遍的函数,允许你设置分隔符,不管是否有表头,不管字符串是否有引号,等等。使用?read.table
查看更多详细信息。
data <- read.table("datafile-noheader.csv",
header=FALSE,
sep="," # 制表位分隔的文件用"\t"
)
打开文件的文件选择器
某些平台,使用file.choose()
可以打开文件选择的对话窗口;其他平台则会提示用户输入一个文件名。
data <- read.csv(file.choose())
把字符串看作因子(factor)或字符(character)
默认条件下,数据中的字符串都被转换为因子。如果你用read.csv()
载入数据,所有的文本列都会被视为因子,即便它被处理为字符串更有意义。要这么做,使用 stringsAsFactors=FALSE
:
data <- read.csv("datafile.csv", stringsAsFactors=FALSE)
# 将某一列转化为因子
data$Sex <- factor(data$Sex)
另一种将他们加载为因子,把某一列转换为字符的方法:
data <- read.csv("datafile.csv")
data$First <- as.character(data$First)
data$Last <- as.character(data$Last)
# 另一种方法:转化名为“First”和“Last”的两列
stringcols <- c("First","Last")
data[stringcols] <- lapply(data[stringcols], as.character)
从网上导入文件
也可以从URL加载数据。这些(很长的)URL可以加载相关文件。
data <- read.csv("http://www.cookbook-r.com/Data_input_and_output/Loading_data_from_a_file/datafile.csv")
# 读取没有表头的CSV文件
data <- read.csv("http://www.cookbook-r.com/Data_input_and_output/Loading_data_from_a_file/datafile-noheader.csv", header=FALSE)
# 手动添加表头
names(data) <- c("First","Last","Sex","Number")
上述所使用的数据文件:
"First","Last","Sex","Number"
"Currer","Bell","F",2
"Dr.","Seuss","M",49
"","Student",NA,21
"Currer","Bell","F",2
"Dr.","Seuss","M",49
"","Student",NA,21
定宽文本文件
假如你的数据列宽固定,如下例:
First Last Sex Number
Currer Bell F 2
Dr. Seuss M 49
"" Student NA 21
读取这种数据的一种方式是简单地使用read.table()
函数strip.white=TRUE
,可以清除额外的空格。
read.table("clipboard", header=TRUE, strip.white=TRUE)
然而,你的数据文件可能包含空间列,或列没有空格分开,这样,scores列表示六个不同的测量值,每一个从0到3。
subject sex scores
N 1 M 113311
NE 2 F 112231
S 3 F 111221
W 4 M 011002
这种情况,你可能需要使用read.fwf()
函数。如果你读的列名来自于文件,它要求他们用分隔符(如:制表位,空格,逗号)分开。如果有多个空格分开将他们分开,如下例,你需要直接指定列的名称。
# 指定列的名称
read.fwf("myfile.txt",
c(7,5,-2,1,1,1,1,1,1), # 列的宽度,-2意味着放弃这些列
skip=1, # 跳过第一行(包括表头)
col.names=c("subject","sex","s1","s2","s3","s4","s5","s6"),
strip.white=TRUE) # 跳过每个数据的前导和尾随
#> subject sex s1 s2 s3 s4 s5 s6
#> 1 N 1 M 1 1 3 3 1 1
#> 2 NE 2 F 1 1 2 2 3 1
#> 3 S 3 F 1 1 1 2 2 1
#> 4 W 4 M 0 1 1 0 0 2
# subject sex s1 s2 s3 s4 s5 s6
# N 1 M 1 1 3 3 1 1
# NE 2 F 1 1 2 2 3 1
# S 3 F 1 1 1 2 2 1
# W 4 M 0 1 1 0 0 2
# 如果第一行如下:
# subject,sex,scores
# 我们可以使用header=TRUE
read.fwf("myfile.txt", c(7,5,-2,1,1,1,1,1,1), header=TRUE, strip.white=TRUE)
#> Error in read.table(file = FILE, header = header, sep = sep, row.names = row.names, : more columns than column names
# 错误:列比例名多
Excel文件
gdata
包里的read.xls
函数可以读取Excel文件。
library(gdata)
data <- read.xls("data.xls")
gdata
包,见http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-data.html#Reading-Excel-spreadsheets.
包的安装,见Basics-安装和使用R包
SPSS数据
foreign
包里的read.spss
函数可以读取SPSS文件。
library(foreign)
data <- read.spss("data.sav", to.data.frame=TRUE)
原文链接:http://www.cookbook-r.com/Data_input_and_output/Loading_data_from_a_file/