脊髓空洞症目前尚无特效疗法，临床以对症治疗为主，近期手术疗效明显，但手术亦非根治性手术。
一、药物治疗
可给予B族维生素、肌苷、辅酶A等维持神经功能、提高机体能量代谢，伴有疼痛者可给予镇痛剂。
1、B族维生素：B族维生素是一种营养神经的药物，维持神经系统的正常功能，常用的B族维生素包括维生素B1、维生素B6和维生素B12等。
2、肌苷：肌苷参与体内能量代谢及蛋白质的合成，提高各种酶的活性，刺激机体产生抗体，提高免疫力，同时还有增强白细胞增生的作用。
3、镇痛药：镇痛药的应用可以减轻患者疼痛、消除因疼痛而产生的恐惧不安的不安情绪，其中包括阿司匹林和吗啡等药物，而药物的选择可以根据患者病情的严重程度而确定。
二、手术治疗
较大空洞伴椎管梗阻可行上颈段椎板切除减压术，合并颈枕区畸形及小脑扁桃体下疝可行枕骨下减压，手术矫治颅骨及神经组织畸形。继发于创伤、感染的脊髓空洞及张力性空洞可行空洞-蛛网膜下腔分流术。合并Arnold-Chiari畸形的患者应先考虑脑脊液分流，部分患者术后症状可有所改善；脊髓内肿瘤所致空洞可行肿瘤切除术；囊性空洞行减压术后压力可暂时解除，但常见复发。
