1 GWAS的目录
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历史
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来自 (ss)GBLUP
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单SNP回归
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求解SNP效应使用
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GWAS的一些细节
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2 遗传评估中的非加性效应
来自Zulma G. Vitezica(INPT/INRAE)
生物效应(biological effects) VS 统计效应(statistical effects)
生物效应-显性或上位效应
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• 不幸的是，我们并不了解所有的基因作用和通路
• 出于多种目的，我们需要做出假设/定义理论
统计效应(statistical effects)
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显性效应本质上是残差
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两对的上位效应例子
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统计和生理效应
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数量性状的遗传结构不能从方差分量分析中推断出来
• 基因的生物上位作用有助于加性和其他遗传变异成分
• 基因作用的种类和方差分量之间没有对应关系。
这些数学公式能够起到什么作用呢？
在不知道真正的作用基因的情况下，这提供了工具
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包含非加性效应的模型GDBLUP及其延伸正在发展中
非加性效应的遗传评估：
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开始之前的准备：
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还有的关系矩阵：
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非加性效应的遗传评估在杂交作物中：
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近交衰退 / 杂种优势
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Runs of homozygosity (ROHs)
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可能的用途
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但是前两种不好
猪上的例子
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肉牛上的例子
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小结
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第三种作用-选配
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猪上的例子（相同品种）
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交配的分配：
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小结
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猪上的例子（不同品种）
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猪的遗传提高
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选配结论
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然而，模拟 F1 杂交（猪）中的交配程序并没有产生额外的性能
总结
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查看综述
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