某些人口口声声说袁擅杀毛文龙，那崇祯为什么不为毛翻案？毛钰更是跟着孔有德去湖南，屠杀明朝崇祯宗室，毛文龙之死，尚可喜都说袁崇焕受政府意诛杀的，袁崇焕死后，毛文龙被杀之事稍白，毛承禄聚军登州，以王氏之逼为由，公开反明。
尚可喜是当事人，他说的，比任何人都要接近。
“毛帅受朝廷委寄，赐便宜甚重，一旦书生奉政府意，出片言立死军前。”——清·尚可喜，《平南王元功垂范》卷3。
毛文龙老乡王思任写信给茅元仪，并不怪罪袁崇焕，而特指背后之人，说谁教袁崇焕干的，信中称：“顷见袁督师赚杀毛帅，此朱亥伎俩也，谁为画此策者？——（王思任《简茅止生》）
《崇祯长编》：“（崇祯4年闰11月）登州援凌游击孔有德叛……广鹿岛副将毛承禄，文龙义子之首也，亦率其众入登从贼，与有时并称总兵，二人既同逆，贼势益张……自文龙诛，部下义子耿仲明、李九成、孔有德等畏罪逃四方，后闻袁崇焕磔死，文龙事稍白，复相聚于登，夤缘为将。然此辈数犷悍，贪婪不知法度，视登为金穴，欲得而甘心焉。三人之中仲明尤多权智，九成勇敢善战，始为元化委买西马，所赍马价荡尽，不敢归，流劫至吴桥，适与有德兵遇，而其子应元亦在营中，乃相与密谋，以为马价既尽，反亦死，不反亦死，不如一逞可以得志，遂劫有德而叛。沿途六城之破，皆九成为先驱，有德以九成父子材武且有首事之勋，故让而先之。”
杀毛文龙，崇祯皇帝有份，毛承斗、尚可喜、孔有德都知道，所以，孔有德更是为毛文龙报仇，屠杀明宗室。
《小腆纪年》：“孔有德、耿仲明、尚可喜三人皆以饶勇善斗事毛文龙；文龙养为孙，有德名毛永诗、仲明名毛有杰、可喜名毛永喜。庄烈帝既杀毛文龙，三人皆自皮岛归我大清；有德封恭顺王、仲明怀顺王、可喜智顺王。既从世祖入关定天下。顺治六年，有德改封定南王、仲明改靖南王、可喜改平南王；所谓三王也。是时，奉命征湖南。”
“将军死以冤，而其事竟白如胆日！”——孔有德、毛奇龄，《毛总戎墓志铭》。
《续明纪事本末》：永历六年，……有德以毛文龙部首乱登、莱，叛明渡海，得「天佑兵」之号；比入湖南、广西，杀明宗室不可纪。自是死，裔亦绝。
《表忠录》记载：“（毛珏）尝之洞庭湖，定南王孔有德与坐舟中，盲风浪涌，故校邢姓者，见大将军衣冠带剑曰：‘若语我儿，我在也，无恐’，邢告珏及王（孔有德），皆向空拜，风忽止。自是军中传将军为神，益敬爱珏云。”
《清实录顺治朝实录》：“平南大将军恭顺王孔有德以平湖南捷闻。”
