哥廷根大学在自然科学和人文科学方面都有出色的研究成果,是一所有国际声誉的研究导向型大学。
在自然科学领域设有哥廷根伯恩斯坦神经科学研究、哥廷根环境科学研究、大脑分子生理学研究、欧洲神经科学研究、哥廷根分子生物学研究、神经系统科学研究、热带/亚热带农业和林业研究、农业和环境研究、畜牧生产和技术研究、森林生态系统研究、生物多样性和生态、自然保护研究等重要研究中心。哥廷根大学图书馆藏书丰富,是德国五大图书馆之一。各个院系和研究所都有自己的专业图书馆。
学校各院系共设有170多个研究所,系主任都是哥廷根科学院的成员。哥廷根大学一直与哥廷根科学院保持着合作关系。另外哥廷根大学还和哥廷根4家马克斯・普朗克研究所(分别为马克斯・普朗克宗教与少数民族多元化研究所(前身为历史研究所)、生物物理化学研究所、临床医学研究所和动力学研究所)、马克斯・普朗克太阳能研究所、德国太空研究中心和德国灵长类动物研究中心等有学科上的合作,使哥廷根保持着科学研究上的领先地位。