生物信息分析过程中，很多步骤需要控制软件本身的假阳性，而使用模拟数据就可以很好的做到这一点。
1 ART 软件的安装
1.1 直接下载编译好的二进制可执行文件
下载地址： https://www.niehs.nih.gov/research/resources/software/biostatistics/art/index.cfm
也可以按照需求点击下面连接下载：
| Linux | MacOS X | Windows | |
|---|---|---|---|
| 64-bit system | ART-bin-MountRainier-2016.06.05-Linux64.tgz (11MB) | ART-bin-MountRainier-2016.06.05-MacOS64.tgz (4MB) | ART-bin-MountRainier-2016.06.05-Win64.zip (5MB) |
| 32-bit system | ART-bin-MountRainier-2016.06.05-Linux32.tgz (6MB) | ART-bin-MountRainier-2016.06.05-MacOS32.tgz (4MB) | ART-bin-MountRainier-2016.06.05-Win32.zip (5MB) |
1.2 下载源码自行编译
- Linux OS: ART-src-MountRainier-2016.06.05-Linux.tgz (11MB)
- Mac OS X: ART-src-MountRainier-2016.06.05-MacOS.tgz (10MB)
2 ART 的使用
使用cDNA模拟 Illumina Hiseq2000 RNASeq 测序数据
art_illumina -ss HSXt -p -sam -i ../Ref/ref_dna.fa -l 150 -f 5 -o out
参考信息：
文章连接：https://academic.oup.com/bioinformatics/article/28/4/593/213322
