安装前提：安装R语言，安装Rstudio，安装成功后切换到合适的镜像源，如果没有新建项目。开始工作前记得新建项目。（对于windows系统，要额外安装Rtools，安装后需要手动配置路径，记得这里要添加两条来自不同bin目录的路径）
1，Bioconductor的安装
为了方便安装生信相关的包，先安装Bioconductor（Bioconductor介绍），这是基因组数据分析相关的软件包仓库，相较于CRAN上的包更全更新。
代码：
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(version = "3.10")
（注意如果版本更新，代码可能会变，在官网查询安装说明可更新）
2，安装WGCNA，GEOqueary, limma,DESeq2,edgeR
在前面安装完Bioconductor后，利用BiocManager命令安装上述常用的包。
WGCNA：加权基因共表达网络分析
GEOqueary：用于下载GEO数据
limma：基因芯片表达矩阵的分析
DESeq2：差异基因分析
edgeR：差异基因分析
代码：
BiocManager::install("WGCNA")
(其他几个包的安装命令相同，注意引号）
安装过程要安装各种依赖包，如果出现安装依赖包失败，就先单独安装该依赖包，然后再次执行上述命令，注意，对于新升级后的mac系统，可能出现如下因为stadio.h文件缺失的报错。
解决办法如下：
今天继续安装一些R包，主要是如下：
GSEABase，GSVA，clusterProfiler，FactoMineR，factoextra，pheatmap，ggpubr，biomaRt
org.Hs.eg.db，hgu133plus2.db，KEGG.db
在安装FactoMineR的依赖包的时候发现，nloptr这个包装不上，报错情况如下：
这里发现，在从source更新nloptr，安装的时候就会出现编译问题，暂时未发现解决办法，但是旧版本的nloptr包可以使用。
