1.创建单独的conda环境安装sift4g
conda create -n sift4g
mamba install -y sift4g -c bioconda
#依赖
conda install gcc_impl_linux-64
2.需要自己构建想研究物种的SIFT数据库，需要安装几个对应软件和perl模块
2.1 SIFT4G_Create_Genomic_DB （内含make-SIFT-db-all.pl）
git clone https://github.com/pauline-ng/SIFT4G_Create_Genomic_DB.git
2.2 下载安装DBI
wget-c http://www.cpan.org/modules/by-module/DBD/DBI-1.643.tar.gz
tar-zxvf DBI-1.643.tar.gz
cd DBI-1.643
perl Makefile.PL
make
make test
make install
2.3 安装LWP
perl -MCPAN -e "install Bundle::LWP"
perl -MCPAN -e"install HTML::Formatter"
perl -MCPAN -e "install IO::Socket::SSL and OpenSSL"
4.安装bioperl
wget https://cpan.metacpan.org/authors/id/C/CJ/CJFIELDS/BioPerl-1.7.7.tar.gz
tar -zxvf BioPerl-1.7.7.tar.gz
cd BioPerl-1.7.7
perl Makefile.PL
make
make test
make install
##bioperl的检查make test可能无法通过.但是不影响后续安装和使用。
2.5 通过CPAN安装Switch.pm
输入命令cpan。
在提示符下cpan[1]>，键入install Switch。
完成后，输入exit。
参考：
https://www.jianshu.com/p/906f130c0529
https://www.tsingfun.com/it/os_kernel/2538.html
