linux环境下的软件安装

conda介绍

（1）conda是大Boss，是一个涵盖许多领域的软件包管理器。
（2）anaconda是总管。
（3）miniconda是区域经理，负责生信领域。

下载miniconda

1.（1）https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/（2） 查看服务器是多少位的：输入命令 uname -a
（3）安装最新版本（latest）
（4）右键-复制下载链接

2. （1）登陆服务器，进入biosoft目录：cd ~/biosoft
   （2）wget +复制的下载链接

   
   
   
   

   (3)激活conda：source ~/.bashrc

   
   
   
   （4）添加镜像

使用清华镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

使用conda

1. 查看当前服务器上安装的所有软件列表 ：conda list

   
   

2. 搜索conda软件：conda search fastqc

   
   

3. 安装软件：conda install fastqc -y 【-y是yes】

   
   

4. 卸载软件 ：conda remove fastqc -y