下载R和Rstudio
R的官方下载https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/
此处选择base下载Rstudio
https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/
此处版本随电脑配置选即可
查看电脑用户名,必须为英文才行,否则会安装失败,可以临时建立新用户。
调试Rstudio
于左上工具栏,选择Tools最后一个选项,后选择packege,
先切换镜像,可在Appearance处对颜色进行调整
R 安装升级后的若干规定动作
先输入
file.edit('~/.Renviron')
点击run,会进入一个空白的文本,在里面填写,这个
D:/Rlib
表示,以后所有的R包装到这个目录。 关闭这个文件,并保存。回到最初的页面输入
file.edit('~/.Rprofile')
点run,在弹出的界面输入,
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
#bioconductor
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/",
CRANextra = "http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin"))
#cran
安装 BiocInstaller
用迅雷下载它https://bioconductor.org/biocLite.R
后以Rstudio打开,在开头处加入
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
#bioconductor
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/",
CRANextra = "http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin"))
#cran
关闭并保存,回到最初的页面输入
getwd()
即可看到R的安装路径,将刚才的文件转移到这即可
随后输入
source("biocLite.R")
BiocInstaller::biocLite()
完成安装
可以随便加载一个包试试
install.packages("tidyverse")
BiocInstaller::biocLite("limma")
指令
1.重新设置存储路径
setwd(dir="文件位置")
2.getwd可查看存储路径
3.查看文件
list.files()
4.查看文件信息
ls() #列出变量名
str(a) #打出变量的具体信息
ls(all.name=TRUE)#将以.开头的对象也一并列出
5.赋值
赋值符号用<-,这是小于号加上减号,也可以按Alt加上减号
x<- 1+2 意思是把1+2的运算结果赋值给x,赋值后,x会显示在右上角的框,Environment里的Value列表里
直接输入x 回车 出现3,前面的那个[1]是个行号,3就是x的值
6.删除
rm()
内填入变量即可
7.列出历史纪录
history() #列出全部
history(10)#只列出指定条数的记录
8.清空屏幕
ctrl+l
9.保存工作空间
save.image保存数据和绘图函数。