学习小组Day4笔记-----张钧保

下载R和Rstudio

R的官方下载https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/

此处选择base
版本选择

下载Rstudio
https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/
此处版本随电脑配置选即可

查看电脑用户名,必须为英文才行,否则会安装失败,可以临时建立新用户。

调试Rstudio

于左上工具栏,选择Tools最后一个选项,后选择packege,

切换镜像

先切换镜像,可在Appearance处对颜色进行调整

R 安装升级后的若干规定动作

新建文件

先输入
file.edit('~/.Renviron')
点击run,会进入一个空白的文本,在里面填写,这个 D:/Rlib表示,以后所有的R包装到这个目录。 关闭这个文件,并保存。
回到最初的页面输入
file.edit('~/.Rprofile')
点run,在弹出的界面输入,

options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
#bioconductor

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/",
 CRANextra = "http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin"))
#cran

安装 BiocInstaller

用迅雷下载它https://bioconductor.org/biocLite.R
后以Rstudio打开,在开头处加入

options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
#bioconductor

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/",
 CRANextra = "http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin"))
#cran

关闭并保存,回到最初的页面输入
getwd()
即可看到R的安装路径,将刚才的文件转移到这即可
随后输入

source("biocLite.R")
BiocInstaller::biocLite()

完成安装

可以随便加载一个包试试

install.packages("tidyverse")
BiocInstaller::biocLite("limma")

指令

1.重新设置存储路径
setwd(dir="文件位置")
2.getwd可查看存储路径
3.查看文件
list.files()
4.查看文件信息

ls() #列出变量名
str(a)  #打出变量的具体信息
ls(all.name=TRUE)#将以.开头的对象也一并列出

5.赋值
赋值符号用<-,这是小于号加上减号,也可以按Alt加上减号
x<- 1+2 意思是把1+2的运算结果赋值给x,赋值后,x会显示在右上角的框,Environment里的Value列表里
直接输入x 回车 出现3,前面的那个[1]是个行号,3就是x的值

赋值

6.删除

rm()

内填入变量即可
7.列出历史纪录
history() #列出全部
history(10)#只列出指定条数的记录
8.清空屏幕
ctrl+l
9.保存工作空间
save.image保存数据和绘图函数。

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 212,332评论 6 493
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 90,508评论 3 385
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 157,812评论 0 348
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 56,607评论 1 284
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 65,728评论 6 386
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 49,919评论 1 290
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 39,071评论 3 410
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 37,802评论 0 268
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 44,256评论 1 303
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 36,576评论 2 327
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 38,712评论 1 341
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 34,389评论 4 332
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 40,032评论 3 316
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 30,798评论 0 21
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,026评论 1 266
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 46,473评论 2 360
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 43,606评论 2 350

推荐阅读更多精彩内容