conda安装

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激活conda

source  ~/.bashrc

添加镜像

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

conda使用

conda install fastqc - y #安装fastqc
fastqc --help #确认安装成功
conda remove fastqc -y #卸载软件

conda环境

conda info --envs #查看已建立环境
conda create -n env_name
conda create -n rna-seq python fastqc trimmomatic -y
source activate env_name#激活环境
conda deactivate#退出环境

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