ChIP-步骤关键点

1.使用fastqc进行质检

主要看总体reads quality 、sequence composition 、GCbias 、Adaptor pollution

2.比对之后得到的sam文件（TEXT.file）BAM文件是压缩后的并且含有index的格式文件

3.使用IGV进行可视化

4.peak数目取决于callpeak使用方法以及卡的阈值。reads越多并不意味着更多的peaks。 不同的方法可能会的到60-80相似的peaks

5.对于转录因子，6-10million reads is minimum且足够的 、15-20 millionis是组蛋白修饰

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