2019APT(011)-002 利用Q-PCR测试Tm检测小分子aptamer的亲和力

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推荐语：简单的方法。特别适合小分子aptamer的批量鉴定。我们曾试过，后来放弃了，小伙伴做的重复性不大好。这篇文章的数据看起来不错。推荐尝试，只需要Q-PCR仪器即可。

一、内容简介：

原理，小分子与aptamer结合之后，会稳定aptamer的结构，从而导致Tm值升高。

文章测试了乙醇胺aptamer与乙醇胺在不同浓度下结合后，Tm值得变化。文章显示Tm值相差超过12度。

实验方法：2.2.3. PCR protocolThe PCR machine (LightCycler 480, Roche) was set to heat first till 99 C (rate 4.4 C/Sec) followed by holding for 5 min to ensure the complete denaturing of any DNA base pairings. Then, the fluorescence was measured from 95 C to 20C with the SYBR Green filter (465 nm excitation and 510 nm emission) and a rate of 0.11 C/Sec.

评论：这个方法我们也曾尝试过，但是实验结果重复性不是太好，小伙伴做了一段时间放弃了。而且仪器也是相同的。不知道是操作问题，还是我们筛选的aptamre不适合这种方法。

二、关键词：应用  Q-PCR Tm  亲和力

三、文献信息：

1    Mahmoud, M., Laufer, S. & Deigner, H. P. An aptamer based thermofluorimetric assay for ethanolamine.Biochimie, doi:10.1016/j.biochi.2019.01.014 (2019).

四、原文链接

https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0300-9084(19)30022-7

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