植物基因组研究进展
2000年12月,第一个植物参考基因组—拟南芥基因组全序列公布,标志着植物基因组时代的开始。在已经过去的20年中,已经有数百种植物发表了基因组,截止至2020年底,已经有788个不同植物物种的1031个基因组完成了测序和发表,并且这一数字正在继续呈指数性增长。
2000-2020年发表的植物基因组(蓝色为染色体水平)
为什么要做植物基因组研究
在2000-2010年这个时间阶段,植物基因组测序主要集中在模式植物和经济作物,其目标主要是提供高质量的参考基因组,用以辅助现代作物育种。
在2010-2020年这个时间阶段,植物基因组测序呈井喷式增长,除作物范围的植物物种外,一些具有特殊生活型的植物、处在特殊分类位置的植物、具有较高药用价值的植物、濒危保护植物,都进行了全基因组测序。
尽管基因组文章看似公式化,并遵循了类似的基因组特征分析流程,但每一个新的参考基因组都被认为是一个重大突破,因为它为后续研究提供了必要的基础和新的见解。
参考基因组的指数增长可以提高我们对植物多样性遗传基础的理解,并提供大量的与重要性状和环境适应相关的基因和变异谱,这些都极大地推进了植物生物学所有学科的研究。