极快速度下载并使用TCGA数据

首先下载表达矩阵的最快方式就是，登陆网站：cBioPortal；cBioPortal for Cancer Genomics；

第一步：点击下图红色圈

image.png

第二步：在红圈处搜索你需要的癌症类型，比如“liver”

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第三步：按照自己需求，点击下载

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第四步：打开下载的数据

1 临床样本信息
2 表达矩阵（一般选用counts），第二个红圈，使用R打开，进行你想要的任何操作；


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此方法比一般从TCGA数据库下载那些原始数据进行操作更简单，快速。

此番方法唯一的缺点就是下载不到正常对照组数据，不过也没关系TCGA的对照组数据样本量很少；最好的方法是取GTEx下载，下次讲解具体办法。

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