在辟谷的第一天到第五天时，体重减轻最为明显，一天平均会减轻1至2千克，从第5天开始，每天减轻0.5至1千克，以后几乎都是以一定的递减方式减轻体重(有时也有例外，视乎每人的自身体质因素及配合情况而定)。
辟谷其间少数人会出现气攻病灶现象，有的病好似加重，或者排泄病毒，拉出黑色东西，如乏力或容易疲惫等，这是身体自我修复的正常反应。
在辟谷期间，高血压患者的血压会显著下降，低血压患者有的血压反而会上升，但视觉、听觉及触觉变得敏锐，记忆力和联想力也会增强，白细胞的数量在辟谷第一周之内没有改变，第7天开始增加，至第11天起急速增加，日增1.57 倍甚至更多，说明辟谷能提高机体免疫力，一部分人在辟谷期间，全身会释放出一种特有的臭气味，连呼出的气体亦有臭味，这是由于体内的代谢废物，有毒物质经皮肤排出体外的原故。
辟谷初期，口腔内粘着性增高，照镜子看舌面，长了黄色的舌苔，甚至有的人呈现黑色舌苔，10天以内很少清切，若继续辟谷，舌苔便会清洁，表示毒素排出，身心净化。
辟谷期间大便次数减少，一般在辟谷开始的最初1-4天内排一次便，这种大便叫宿便，宿便的颜色一般是黑色或黑绿色或茶褐色，呈泥巴状(也有少数例外)，这是正常现象。
