化学性污染包括各种有害金属、非金属、有机化合物和无机化合物。
1．农药污染
常见农药有熏蒸剂、杀虫剂、除草剂、杀菌剂等，这些农药若使用不当或使用过量使食品受到污染或在食品中有一定残留。
2．工业三废污染
工业生产排出的废水、废气、废渣（俗称“三废”）中含有各种有毒有害物质，可污染水中生物、农作物、牧草等等，进而污染各种食品。
3．包装材料的污染
质量不合卫生要求的容器、器械、包装材料和运输工具接触食品时，其中的有害物质污染食品。
4．添加剂的污染
为了达到一定加工目的，有意识向食品中加入食品添加剂，如果食品添加剂本身不符合卫生要求，或其中含有有害杂质，都可造成食品污染。
