标题:STAG2 loss rewires oncogenic and developmental programs to promote metastasis in Ewing sarcoma
即:STAG2缺失重组致癌和发育程序以促进尤因肉瘤的转移
主要内容
该文证明含有STAG2的粘着蛋白复合物占据增强子和多梳抑制复合物(PRC2)标记的调控区域。STAG2的遗传抑制导致内聚素-STAG1复合物的代偿性增加,但在增强子丰富的区域没有,并导致顺式染色质相互作用的重新编程由融合转录因子EWS/FLI1驱动的致癌基因程序inSTAG2knockout细胞受到高度干扰,部分原因是增强子启动子接触的改变。此外,STAG2的缺失也破坏了PRC2介导的基因表达调控。这些转录变化结合在一起,共同调节EWS/FLI1、迁移和神经发育程序,功能研究表明STAG2的缺失增强了尤文肉瘤异种移植的转移潜能。
1.STAG2的丢失并不一定会改变细胞的生长,但会改变内聚蛋白复合物的组成,使细胞对TAG1的缺失敏感
(A)描述CRISPR(Avana)Depmap v20Q3数据中789个细胞系中STAG2、SMC1A、SMC3和RAD21基因效应(CERES)分数的分布。
(B) 显示亲代或克隆选择的非靶向(NT)或TAG2KO A673和TC71细胞累积加倍平均值±SD的线形图。指数增长拟合曲线的成对比较分析。
(C) 图中显示了基于EdU(5-乙炔基-20-脱氧尿苷)掺入的细胞周期分析和代表性流式细胞术图(左)。两个独立实验作为平均值±标准差条形图(右)。
(D和E)对指定的蛋白质进行亚细胞分离(D)或用SMC1A、SMC3或IgG(E)进行免疫沉淀,然后进行western blot。
(F) 在等基因NT和Stag2KO A673克隆细胞中进行基因组规模CRISPR/Cas9筛选。火山图,用于对等基因NT与USSTAG2KO处理读取进行全基因组差异分析。