好久不见!
这里分享一种单细胞数据可视化的图形修饰。
先加载一个seurat公共的单细胞数据集
InstallData("pbmc3k")
data("pbmc3k")
PBMC <- pbmc3k.final
PBMC = UpdateSeuratObject(object = PBMC)
一般展示marker基因用这种点图:
Markers <- c('AGER','SCGB3A2','TPPP3','CD68','FCN1','CD1C','CD14','MARCO',
'CXCR2','IL3RA','CD3D','CD8A','KLRF1','CD79A','MS4A1','S100A8')
DotPlot(PBMC, features = Markers)
额,很普通!
所以修饰修饰,让它看起来更舒服,也对得起测序花的钱。
所幸,发现了一个新的包,可以让他更好:
快用起来吧
文章字数虽少,但不敷衍,东西是实实在在的好东西!