探序基因肿瘤研究院 整理
1. 准备工作
下载地址：https://software.broadinstitute.org/software/igv/download
解压缩，sh igv.sh即可运行
配置~/.bashrc中环境变量：
alias igv="/home/software/IGV_Linux_2.17.4/igv.sh"
即可在需要时，输入igv xxx.bam即可运行igv
配置相应的java环境，并在~/.bashrc中设置环境变量，
export JAVA_HOME=/home/software/jdk-21.0.1
export PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH
export CLASSPATH=.:$JAVA_HOME/lib/dt.jar:$JAVA_HOME/lib/tools.jar
export JRE_HOME=$JAVA_HOME/jre
配置内存：在~/.igv/java_arguments文件中，增加一行：-Xmx16G
2. 具体使用
参考：CSDN-保姆级 IGV 基因组浏览器使用指南（图文详解）
各种文件格式学习：编程学习网-生信分析过程中这些常见文件（fastq/bed/gtf/sam/bam/wig）的格式以及查看方式你都知道吗？
3. 参考基因组
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