一、JAVA环境安装
1、创建Biosofts目录
mkdir ~/Biosofts
2、创建/usr/java文件夹
mkdir /usr/java
3、将jdk-8u172-linux-x64.tar.gz压缩包拖到目录处进行下载，然后解压
sudo tar -vxf ~/Biosofts/jdk-8u172-linux-x64.tar.gz -C /usr/java/
4、创建一个软连接文件
sudo ln -s jdk1.8.0_172 latest
sudo ln -s /usr/java/latest default
5、进入编辑模式，末尾加上如下几行：
image.png
6、输入指令：
source /etc/profile
7、查看java是否安装成功，显示安装成功
捕获3.PNG
出现的问题：进入编辑页面后，移动光标时会出现字母，无法编辑
捕x.PNG
解决办法：退出编辑状态，卸载掉原来有问题的vim-common组件：
sudo apt-get remove vim-common
卸载完成后，输入以下命令安装vim
sudo apt-get install vim
安装完成后即可进行编辑
二、FastQC下载安装
1、 将fastqc_v0.11.7.zip压缩包下载到Biosofts目录下，再进行解压
unzip ~/Biosofts/fastqc_v0.11.7.zip -d ~/Biosofts/
2、发现没有执行权限
image.png
可借助chmod指令修改文件权限：
chmod 777 /home/huyimin/Biosofts/FastQC/fastqc
3、加入环境变量后，就不用再输入路径了
echo 'export PATH=~/Biosofts/FastQC:$PATH' >>~/.bashrc
4、使环境变量生效
source ~/.bashrc
5、输入指令
fastqc -h
安装成功
image.png
