千年后再度回归的彗星将在一个月后造访了地球上一个平凡的日本小镇系守町，镇上住着一位我们美丽而又性格懦弱胆怯忧郁的女主三叶，她和全心全意信奉着宫水神的外婆还有她的妹妹四叶三个人相依为命，虽然三叶也有爸爸妈妈，但是她的爸爸是入赘来的，妈妈在生下四叶后不久就因病去世了，妈妈死后，爸爸因为要去竞选镇长而不愿意留在家里祭祀他不怎么信奉的宫水大神，而和外婆大吵了一架关系决裂，随后三叶的爸爸就去全心全意的竞选小镇的镇长去了，而且从此后三叶爸爸就很少甚至不再回这个家了。
故事是这样的：在千年后再度回归的彗星造访地球的一个月前，日本深山系守镇。一个女高中生三叶，每天都过着烦恼的生活。厌倦了父亲的选举活动，厌倦了家传神社的古老习俗，厌倦了整个小镇子。她憧憬可以去到东京大都市做一个帅哥。
突然有一天，她做了一个梦，变成了一个生活在东京的男孩子。与此同时一个生活在东京的男孩子泷，则梦到自己去到了一个乡下小镇变成了女高中生。
她们通过梦境交换了自己的灵魂，看似是两个平行的线，其实他们生活的时间线有着三年的差距。直到有一天，泷不再联系的上三叶，也不再交换灵魂。
他意识到发生了什么。就去查找所有的蛛丝马迹，他发现在彗星来临的那天，系守镇的村民都被掉下来的彗星残骸杀死了，其中包括三叶。
于是，他去到系守镇去寻找三叶。多日未果，他想到了当日和三叶奶奶供奉的口嚼酒，他想到了三叶奶奶的预言，每个人，每个事物都是结，分开了，扭曲了，离开了，最终还是会再相遇。
片子的每幅画面都精彩绝伦，细腻无比，好多都是来自真实的美景，再次打破了二次元的壁，来到了三次元。
清晨醒来的时候，不知道为什么而哭；做过梦总是回想不起来，却由一切消失的丧失感。梦的忧伤，情的思念，就在这似有似无的梦境中，成了欲追寻却惘然的迷雾。
“庄生晓梦迷蝴蝶，望帝春心托杜鹃。沧海月明珠有泪，蓝田日暖玉生烟。此情可待成追忆，只是当时已惘然。”李商隐的这首无题诗，恰成这情思与梦幻的注脚。那“昨夜星辰昨夜风”的遐思，构成了曾经动心却无处追寻的记忆。而“心有灵犀一点通”的灵感，却淹没在孤单却无力挽回的等待中。
这就是动漫《你的名字。》的主题。它刻画了一对男女超越时空、心身交融的爱恋，也把苦苦等待、奋力追寻的情思推向极致。在我看来，这部动漫把爱情想象中的两个主题表达得淋漓尽致，那就是：梦境中身心融合的想象，以及现实中期待重逢的心愿。连接想象和心愿的，则是颇具励志成分的奔跑和行动。
