linux环境下的软件安装

conda安装

• 1、软件来源
  清华镜像
• 2、安装命令
  wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
• 3、激活
  source ~/.bashrc
• 4、添加镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes

• 5、创建独立环境

conda create -n rnaseq  #  -n 指定环境名称
conda activate rnaseq   #  激活
conda deactivate        #  退出小环境
conda remove -n rnaseq  #  删除小环境

• 6、安装、卸载软件

conda install fastqc
conda remove fastqc