Hypothesis test

参数检验与非参数检验

  • 参数检验即检验模型是基于数据符合或具有某种特征,如t.test即要求数据符合正态分布,而非参数检验则不对数据做任何假设。当数据不符合参数检验的假设条件时,需要使用非参数检验来获得可信的结果。
  • Tips
    • 参数检验中的普遍的一个假设条件是数据符合正态分布,但是根据中心极限定理(central limit theorem, ),但样本数据量足够大时(N > 30),正态分布假设就不再是个问题,我们可以直接使用参数检验,但正态分布检验仍然是推荐的。

一般性假设

  • R中参数检验的一般性假设通常包括两个:正态性和方差齐性
    • R中有多种方法可以进行数据的正态性检验,比如QQplot和shapiro.test()
      • shapiro.test(),H0为数据和正太分布一致,所以当P值小于给定阈值时,可以认为数据不符合正态分布
      • 但是当数据量较小时,建议使用Q-Q plot直接观察数据偏离正态分布数据的程度。
    • R中方差齐性检验,参考方差的比较。

假设检验

  • 两组样本均值的比较
    • t.test
    • Wilcoxon rank sum test
  • 多组样本均值的比较
    • ANOVA test (analysis of variance, parametric): extension of t-test to compare more than two groups.
    • Kruskal-Wallis rank sum test (non-parametric): extension of Wilcoxon rank test to compare more than two groups
  • 方差比较
    • Comparing the variances of two groups: F-test (parametric)
    • Comparison of the variances of more than two groups: Bartlett’s test (parametric), Levene’s test (parametric) and Fligner-Killeen test (non-parametric)

均值的比较

两组样本

多组样本

one way anova (analysis of variance)

  • 即单因素方差分析,多组样本的分组时单个因素分组的,如实验中的control, treat1, treat2
  • 假设条件
    • The observations are obtained independently and randomly from the population defined by the factor levels. 即独立抽样。
    • The data of each factor level are normally distributed. 即正态性
    • These normal populations have a common variance. 即方差齐性
  • 假设:
    • H0 : 多组均值相等;
    • H1 : 至少一组均值不等;

方差比较

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