DAY3 linux环境下的软件的安装与激活
- 软件的介绍
- conda是为管理python包，其是涵盖许多领域的软件包管理器
- miniconda是conda中专门负责生信领域的软件，小而精
- 安装管理器
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检查本机服务器信息：
uname -a截屏2021-07-08 11.23.54.png 登陆服务器
创建一个空目录用于放置后续安装的生信软件
mkdir biosoft转入该目录
cd biosoft-
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wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh截屏2021-07-08 11.28.02.png 复制粘贴此命令行
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- 安装软件
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检查当前管理器软件列表
conda list截屏2021-07-08 11.31.27.png -
安装软件
conda install fastqc -y截屏2021-07-08 11.31.39.png -
确认fastqc安装成功
fastqc --help截屏2021-07-08 11.32.06.png -
卸载软件
conda remove fastqc -y
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- 激活conda
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查看当前conda的环境
conda info --envs1721625709089_.pic.jpg -
建立一个新的环境
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y1731625709452_.pic.jpg -
激活新的conda环境
conda activate rna-seq截屏2021-07-08 11.36.52.png 退出当前环境
conda deactivate
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