生信分析学习笔记 - RNAseq （三） FastQC评估 - 简书 (jianshu.com)
质量检测：FastQC - 简书 (jianshu.com)
转录组数据分析——原始数据质量控制（QC） - 简书 (jianshu.com)
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分别是文件名称，文件类型，测试平台，总序列数，质量差序列数，序列长度和GC占比
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绿色区域代表完全正常，黄色轻度不正常，红色非常不正常，横坐标为读段，纵坐标为测序质量评估，这里的Quality score=-10*lg10(error P)，20%Q表示1%的错误读取率，30%为0.1%错误读取率。黄色块的上下线表示质量25%和75%；蓝色线，平均数；红色线，中位数。一般要求箱线图10%的线大于Q=20。
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表示总体reads平均Q值的分布，横坐标为Q值，纵坐标为读数，越多读数的Q值集中在高分区说明质量越好
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四种碱基在读段不同位置的百分比，横坐标是测试碱基的位置，纵坐标为碱基百分比，理论上百分比差别不大，前端差别较大可能是仪器设备导致的偏差，后端差别较大可能是adapter没有清除，后续可在数据预处理中将其剪出，差异超过10%则非常不好。
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表示GC碱基在所有序列中的分布，红色线表示样品，蓝色线表示理论，双峰可能混有其他物种的DNA
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不确定碱基的含量
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横坐标为序列长度，纵坐标为序列数，理论上都一样
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统计序列完全一样的读数的频率，程度很高可能是bias存在如建库PCR复制，横坐标是一样的次数，纵坐标是一样的reads，以unique reads作为100%
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大量出现的某个序列
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横轴表示碱基位置，纵轴表示百分比，
