益生菌融入温豆浆、牛奶或粥中同时服用，此时，食物相当于益生菌的天然培养基地，有利于其增殖和产生人体需要的营养物质，更好地发挥药效。
1、服用温度应低于37℃
以免活菌被杀死。服用时不要加热，粉剂只能冲入凉开水，也可以倒入口中，直接冲凉开水喝下。为保持菌群活性及浓度，建议冲调水量不超过80ml，且冲泡完成后，请在半小时内服完。
2、最好饭后20分钟在服用
因饭后胃酸浓度降低，更有利于让活菌顺利到达肠道发挥作用。进入胃的食物可稀释或中和大部分胃酸，更有利于让大部分益生菌活着进入小肠。
3、建议益生菌与益生元合用
与益生菌合用效果最佳。益生菌可为肠道益生菌提供能量，促其迅速增殖，效果更好，更有保障。
4、避免与抗生素一起服用
若使用抗生素需间隔2~4小时后服用。抗生素不仅会杀死有害菌也会杀死有益菌，因此在连续使用抗生素后，易发生肠胃菌群不平衡。实践证明，两者使用效果好，不过要记得服用时间要间隔。
5、坚持服用10天以上
坚持服用才能有明显效果，巩固效果最好的连续服用1~2个月，并在之后保持良好均衡的饮食计生户习惯。服用初期发还是呢个一些腹胀、放屁、大便次数增多甚至轻度腹泻的症状，都是肠道调节的正常反应，此时不应停止服用益生菌。
