每日paper - 20220307 - 左右非对称性发育的关键遗传模块

Discovery of a genetic module essential for assigning left–right asymmetry in humans and ancestral vertebrates

2021 年 12 月发表在 Nature Genetics 上,由新加坡A*STAR 研究所的 Bruno Reversade 等研究人员发表。

脊椎动物胚胎发育过程中,有一个称为 left-right organizer (LRO) 的短暂存在的器官,它决定脊椎动物左右对称轴的形成。在 LRO 中,运动纤毛可以打破两侧对称性,在鱼类、两栖类、啮齿类和人类中,LRO 都有运动纤毛;而在鸟类、爬行类、偶蹄类、鲸类中则没有运动纤毛。二者间的区别是如何形成的呢?

研究者们分析这两类脊椎动物中不同的基因,鉴定出了五个编码胞外蛋白的基因,其中 CIROP 基因的功能此前未知。研究表明,CIROP 在有鞭毛 LRO 中特异表达,在斑马鱼和非洲爪蟾中,CIROP(该蛋白编码的肽)只对左侧发育有作用,处于左侧 flow 的下游(见下图b图),但是处于 DAND5 的上游,DAND5 是胚胎发育过程中第一个非对称表达的基因。在 21 个 CIROP 突变的人类病例中,患者们都表现出了隐性的内脏异位。

Fig. 1: Identification of five genes that are mutated or lost in species with a LRO without motile cilia.

对斑马鱼、非洲爪蟾、小鼠的胚胎进行原位杂交,发现 cirop 基因是在有鞭毛 LRO 中特异表达的。

Fig. 2: Cirop is expressed in the LRO of zebrafish, Xenopus and mouse embryos.

在斑马鱼和非洲爪蟾中,cirop 功能丢失会导致内脏异位(heterotaxy,HTX)。研究者们通过在四细胞阶段分别对左侧和右侧进行注射,实现了cirop的左侧/右侧的特异性敲除,发现对左侧胚胎注射会导致缺陷,但是对右侧胚胎进行注射时却不表现出任何缺陷。

Fig. 3: Zebrafish cirop−/− mutants and Xenopus cirop crispants present with LR asymmetry defects.

对左侧胚胎敲低 dand5 的表达,能够缓解 cirop 功能缺失导致的不对称缺陷。这表明 Nodal 信号通路能够补偿 Cirop 的缺失。这也说明在信号通路中,Cirop 在 Dand5 的上游。

Fig. 4: Cirop requirement on the left side of the LRO can be bypassed by Dand5 depletion.

研究者们又进一步证明了 Cirop 对于 dand5 的非对称表达是必不可少的。

Fig. 5: Cirop is required on the left side of the LRO for proper dand5 downregulation downstream of leftward flow.

整篇文章实验数据非常详实,证明了一个在祖先物种中演化出来的遗传模块的存在,这一模块在脊椎动物进化历史上消失了两次,但是对于人类发育过程中的左右区分仍然有非常重要的意义。

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