达芬奇项目与一般的跨学科研究在目标、方法和应用领域上有一些相似之处，但也有其独特之处。
达芬奇项目是一个教育实验，旨在通过实践学习、原型制作和迭代测试来培养可持续发展变革者。它强调“向前失败”的思维方式，鼓励学生在真实环境中解决复杂问题，并通过设计思维和系统思维来处理不确定性。这种项目通常涉及来自不同背景的学生组成跨学科团队，与外部合作伙伴合作，解决具体的可持续发展挑战。
相比之下，一般的跨学科研究通常侧重于理论与实践的结合，强调不同学科之间的知识整合和相互作用。例如，跨学科工程研究（Transdisciplinary Engineering Research）采用更广泛的“整体”视角，考虑情境，强调所有学科在研究产出中的同等重要性。这种研究方法往往用于应对复杂问题，要求从整体上理解问题，而不仅仅是解决各个学科的局部问题。
达芬奇项目特别注重培养学生的社会责任感、有效沟通和问题解决能力，通过主动学习和做中学的方法，使学生能够从不同角度理解特定的可持续性挑战，并学会与外部伙伴合作解决问题。此外，该项目还强调创意自信和韧性，以推动创新。
另一方面，一般的跨学科研究可能更多地关注于学术领域的知识整合，如在大学或研究机构中进行的多学科合作项目。这些项目可能涉及多个领域的专家共同参与，但其重点可能更多在于理论研究和学术贡献。
达芬奇项目不仅是一个跨学科的学习平台，更是一个实践导向的教育项目，旨在通过实际操作和团队合作来培养学生的综合能力，特别是在解决现实世界问题方面的能力。而一般的跨学科研究则可能更侧重于理论探索和学术贡献，尽管两者都强调不同学科之间的合作与整合。
