PlasFlow预测质粒

标题:PlasFlow: predicting plasmid sequences in metagenomic data using genome signatures
杂志:Nucleic acids research
时间:2018
单位:波兰科学院
被引:170(2021.10)

Plasflow相比cBar预测效果更好


预测质粒工具
cBar:https://cge.cbs.dtu.dk/services/PlasmidFinder/
PlasmidFinder:https://cge.cbs.dtu.dk/services/PlasmidFinder/
Recycler:https://github.com/Shamir-Lab/Recycler

PlasFlow GitHub: https://github.com/smaegol/PlasFlow

安装

conda install plasflow

更多:
从宏基因组数据挖掘生境中隐藏的DNA暗物质——质粒

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