高等生物中的修饰似乎更受研究者们的关注,而对于一些低等生物的RNA表观修饰研究说不定会有意想不到的结果。今天分享的这篇就是在锥虫(一种原生动物,寄生虫,能造成宿主嗜睡)中使用ψ-seq系统鉴定snRNA上的假尿嘧啶修饰,就发现锥虫snRNA上的ψ修饰比大部分的真核细胞的都要多,这可能与其不同的生活史和温度相关。
三言两语
1. 锥虫中snRNA含有61个假尿嘧啶修饰:U1(4个),U2(34个),U4(14个),U5(2个),U6(7个)。而在人中,U1(2个),U2(14个),U4(3个),U5(4个),U6(3个);酵母中:U1(2个),U2(5个),U5(1个)。
2.锥虫snRNA上的假尿嘧啶修饰由snoRNA依赖的假尿嘧啶合成酶CBF5催化合成。
3.MTAP(人中同源基因为WDR79)结合在指导snRNA修饰的snoRNA上。
4. snRNA上的ψ修饰影响RNA-RNA以及RNA-protein互作,这可能与ψ修饰能够提供更多的配对氢键,可以提高高温情况下RNA结构的稳定性。
Reference
Rajan, K. S. et al. Pseudouridines on Trypanosoma brucei spliceosomal small nuclear RNAs and their implication for RNA and protein interactions. Nucleic Acids Res 47, 7633-7647 (2019).