七月，王守仁坠马卧床，李东阳常来看望，因李东阳也曾在成化十七年（1481年）坠过马，两人便作文相互唱和。
八月，王守仁作为钦差，督造威宁伯王越坟于河间濬县，驭役夫以十五之法，暇即演八阵图，有识之士便知道王阳明是一个有远大志向的人。
九月，修墓事毕，游览佛教胜地大丕山，作《游大丕山赋》。
在此期间，王阳明大量研读兵书，作了很多批注，汇编成《武经》一册，到天启年间被人发现而刊刻出版，孙元化在此书的序言中说：“大都以我说书，不以书绳我；借书揣事，亦不就书泥书；提纲絜要，洞玄悉微，真可衙官孙、吴而奴隶司马诸人者矣。因思文成当年讨逆藩，平剧寇，功名盖天地，智略冠三军，不过出此编之绪余而小试之耳。”
孙元化的赞美之词虽然不免夸张，但王阳明后来在军事上能屡立奇功，确实不是天才的即兴发挥，他从小喜欢玩争斗游戏、酷爱象棋，熟读兵书，而且有自己的独特感悟。
弘治十三年（1500年）二月，陈白沙去世，生前指定湛若水为自己的传人。
六月，王守仁正式转正，被提拔为“刑部云南清吏司主事”，不久便在朝中形成了一个“西翰林”学术团体，成员多为新科进士，如陈凤梧、潘府、郑岳、杨孟瑛等人，王守仁也是其中的活跃分子，他交游广泛，各种迎来送往不断。
弘治十四年（1501年）八月，王阳明奉命南下，前往直隶、淮安、凤阳、南京、芜湖、庐州、池州等地，会同各当地巡抚、御史审决重囚，多有平反。
在南京，有陈姓将军杀人十八而入狱，陈将军的父亲已殉职疆场，而他的儿子也因贻误战机被诛，案件久拖十余年不决，王阳明下令处决，当地巡抚和御史反复求情，王阳明不听。
罪犯在临刑前对王守仁大喊：“死而有知，必不相舍！”王阳公笑答：“吾不杀汝，十八人之魂当不舍吾。汝死，何能乎？”
九月，王守仁游池州九华山化城寺，吊地藏菩萨塔，赋诗六首；游李太白祠，赋诗二首，其一云：
千古人豪去，空山尚有祠。
竹深荒旧径，藓合失残碑。
云雨罗文藻，溪泉系梦思。
老僧殊未解，犹自索题诗。
王守仁遍访当地寺僧，笔赞长生庵实庵和尚相貌曰：“从来不知光闪闪的气象，也不知圆陀陀的模样。翠竹黄花，说什麽蓬莱方丈。看那山里金地藏，好儿孙，又生个实庵和尚。噫！那些儿妙处，丹青莫状。”
九华山中有一位道士叫蔡蓬头，不知从哪里来的，钱德洪在《阳明先生年谱》中有一段有趣的记载：“是时道者蔡蓬头善谈仙，待以客礼请问。蔡曰：尚未。有顷，屏左右，引至后亭，再拜请问。蔡曰：尚未。问至再三，蔡曰：‘汝后堂后亭礼虽隆，终不忘官相。’一笑而别。”
次年正月，王守仁作《九华山赋》。
