准备工作-安装bzip2

yum install -y bzip2

安装miniconda

下载miniconda

百度/谷歌搜索“miniconda”（是英文网站）=》你会看到linux下面有64-bit、32-bit两种版本=〉接下来，查看自己服务器是多少位的=》安装python3.6对应的版本=〉右键-复制下载链接
cd biosoft
wget 刚才你复制的下载链接
请记住这里的粘贴不是ctrl+c和ctrl+V了，选中，鼠标左键点一下是复制，右键点一下是粘贴

安装miniconda

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

激活miniconda

source ~/.bashrc之后在命令行里输入conda

添加国内镜像

conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/ conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/ conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/ conda config --set show_channel_urls yes

使用miniconda

1查看当前所有软件列表conda list
2搜索软件conda search fastqc
3安装软件conda install fastqc -y加-y是自动安装
4卸载软件conda remove fastqc -y

conda环境

1查看环境conda info --envs前方带为默认环境*
2建立环境

比如我们要处理转录组数据了，好，先建立一个名叫rnaseq的conda环境，然后指定python版本是3，安装软件fastqc、trimmomatic（这两个可以一步完成）
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y

3激活环境source activate rna-seq
4卸载一个环境中的软件

卸载某个软件conda remove -n rna-seq fastqc -y
全部卸载，也就是卸载这个环境conda remove -n rna-seq --all
注意：最后卸载环境的时候，需要先退出当前环境，因为自己肯定不能把自己删除吧，使用source deactivate