134. 形态学重建之细胞计数

8. 形态学图像处理索引

一、 形态学图像重建

  • 形态学重建的核心是测地膨胀和测地腐蚀。

  • 图像的形态学重建涉及两幅图像和一个结构元:图像 F 是标记,包含重建的起点;图像 G 是模板,用来约束重建;结构元 B 定义连通性,通常是全 1 的 3 * 3 陈列。

  • 在二值图像中,测地腐蚀或测地膨胀是将腐蚀或膨胀结果与模板图像 G 进行交集运算(与)或并集运算(或),在灰度图像中的推广则是以求最大值、最小值来取代二值的与或操作。

  • 简单地说,测地膨胀和测地腐蚀就是有条件的膨胀和腐蚀。
    膨胀或腐蚀结果与模板图像进行交集或并集运算,从而对膨胀或腐蚀操作施加了特定的约束。

二、形态学边界清除

  • 从图像中提取目标是图像处理的基本任务,检测接触边界是常用的算法。

  • 对于二值图像I(x,y),开发一种基于形态学重建的边界清除的算法:
    使用原图像 I 作为模板,构造一幅标记图像 F。
    标记图像 F 的边框位置为 I,其它位置均为 0(白色),即:
    F(x,y)=\left\{\begin{aligned} I(x,y),(x,y)在边界上 \\ 0,其它 \end{aligned} \right.
    计算形态学重建R^D_{I}(F) 提取接触边界的目标,由X= I - R^D_I(F)即可得到一幅由图像 I(x,y) 重建的,目标不接触边界的图像 X。

  • 基于形态学重建的边界清除,首先构造标记图像 F。使用原图像 I 作为与操作的掩模模板,可以保护迭代期间所有的前景像素不会被改变。

  • 标记图像 F 的边界为I(x,y),属于接触边界的目标。除原图像中接触边界的目标之外,黑色从边界开始向内不断膨胀,直到充满图像。对收敛的标记图像求补,得到边界清除的重建结果。

三、例程

  • 10.24:基于形态学重建的细胞计数
    本例是基于形态学重建的细胞计数,需要清除边界上不完整的细胞,因此算法原理与边界清除是相同的。由于原图像是浅色背景,二值化处理后的背景为白色,因此用原图像的补集作为模板。
    (1)构造标记图像 F 作为膨胀重建的标记,标记图像的边框位置为 I II,其它位置均为 1;
    (2)使用十字形结构元(MORPH_CROSS),对标记图像 F 进行膨胀恢复;
    (3)用原图像的补集作为模板来约束重建,与膨胀恢复图像进行逻辑与;
    (4)重复图像 F 的重构运算,直到达到稳定收敛状态;
    (5)原图像(白色背景)与收敛的标记图像 F 或运算,得到边界清除的重建结果。
import cv2
import numpy as np
from matplotlib import pyplot as plt

# 10.24: 基于形态学重建的细胞计数
imgGray = cv2.imread(r"E:/OpenCV/rice.jpg", flags=0)  # flags=0 灰度图像
ret, imgBin = cv2.threshold(imgGray, 205, 255, cv2.THRESH_BINARY)  # 二值化处理 (黑色0/白色1)
imgMask = cv2.bitwise_not(imgBin)  # 二值图像的补集

# 构造标记图像
marker = np.zeros_like(imgBin, dtype=np.uint8)
marker[0, :] = imgBin[0, :]
marker[-1, :] = imgBin[-1, :]
marker[:, 0] = imgBin[:, 0]
marker[:, -1] = imgBin[:, -1]
markerIni = marker.copy()  # 标记图像: 边框 f(x,y)=I(x,y),其它为 0

# 形态学重建
element = cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_CROSS, (3, 3))
while True:
    marker_pre = marker  # 保存 F(n-1)
    dilation = cv2.dilate(marker, kernel=element)  # 膨胀重建
    marker = cv2.bitwise_and(dilation, imgMask)  # 原图像作为模板用来约束重建,按位与,有 0 得 0
    if (marker_pre == marker).all():  # F(n)=F(n-1)?,判断是否达到稳定收敛状态
        break
# imgRebuild = imgBin + marker  # 按位或,有 1 得 1
imgRebuild = cv2.bitwise_or(imgBin, marker)  # 按位或,有 1 得 1

# 显示
plt.figure(figsize=(10, 6))
plt.subplot(231), plt.imshow(imgGray, cmap='gray'), plt.title("origin image"), plt.axis("off")
plt.subplot(232), plt.imshow(imgBin, cmap='gray'), plt.title("binary image"), plt.axis("off")
plt.subplot(233), plt.imshow(imgMask, cmap='gray'), plt.title("mask image"), plt.axis("off")
plt.subplot(234), plt.imshow(markerIni, cmap='gray'), plt.title("initial marker"), plt.axis("off")
plt.subplot(235), plt.imshow(marker, cmap='gray'), plt.title("final marker"), plt.axis("off")
plt.subplot(236), plt.imshow(imgRebuild, cmap='gray'), plt.title("rebuild image"), plt.axis("off")
plt.tight_layout()
plt.show()

四、资料

youcans_的博客:
https://blog.csdn.net/youcans/article/details/123527091
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